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News
【C2-58 Axiom Genome-Wide TWB 2.0 Array Plate】於2018年8月1日上線提供服務,平均每個樣本的全基因體基因型鑑定費用NT$1,000,歡迎連結網址http://lims.ncgm.sinica.edu.tw/申請。

HiPipe: Make NGS bioinformatics analysis quick and easy. HiPipe已上線提供使用,歡迎連結網址http://hipipe.ncgm.sinica.edu.tw/使用。


  國家基因體醫學研究中心(前身為國家基因型鑑定中心)於2002年成
立至今,中心成立的長程目標為:(一) 打造台灣成為基因體醫學研究及轉譯醫學研究的國際重鎮,進而發展台灣之生技醫療產業;(二) 持續提供高品質、高通量及全方位之基因型鑑定、次世代核酸定序服務;(三)提供高效能、操作簡易、 價格便宜之web介面的次世代核酸定序生物資訊分析服務給國內研究者及生物科技產業。
  中心憑藉著多年累積的研究能量及對外服務的經驗,可提供使用者整
合性的一站式基因體研究服務。內容包括:在研究初始,研究人員可使用本中心生醫資訊組專為國內相關研究單位及研究人員設計的臨床資料蒐集系統(iQuestion)蒐集樣本並建立樣本資料。在收案進行中,提供樣本高品質之DNA萃取及儲存服務;此外,研究參與人員可透過樣本管理系統(Samportal)進行完整專案/樣本追蹤。在實驗方面,可提供高速、高品質之基因型鑑定及次世代核酸定序服務;NGS實驗數據產生後,可以協助實驗產出的巨量資料儲存與備份。後續資料分析方面,可以提供實驗結果之生物資訊分析(GenePipe and HiPipe)。此外,在統計分析方面,可以提供使用者全基因體關聯性分析之統計諮詢(GWAS)。
  此「一站式」的服務模式幫助國內研究人員,從服務申請諮詢、研究
規劃、實驗設計、樣本製備與管理、實驗管理、實驗操作、巨量資料儲存與備份、統計分析、生物資訊分析及實驗結果之諮詢與討論等;使用者不須再轉介其他公司或研究單位便可以有效率的方式獲得其研究結果。
  本中心設有四大平台,提供基因型鑑定及次世代核酸定序服務:
(1) 短片段重覆基因多型性之基因型鑑定平台(ABI 3730 DNA Analyzer)
(2) 介質輔助雷射脫附性/離子化-飛行時間式質譜儀為基礎之單核苷酸多型性基因型鑑定平台(Sequenom MassARRAY)
(3) 以寡核苷酸陣列雜交為基礎的超高通量基因型鑑定平台(Affymetrix GeneTitan)
(4) illumina MiSeq次世代核酸定序平台
  以上四大平台的建立,使中心可針對使用者在基因體研究及生物資訊
分析服務上的不同需求、經費之多寡及計畫之規模大小,提供多元化的選擇及彈性服務。本中心於2019年9月5日順利通過全國認證基金會(TAF)認證,取得測試領域之TAF認證證書(證書編號 L3618-190905),TAF為ILAC (the International Laboratory Accreditation Cooperation, 國際實驗室認證聯盟) 相互承認協議之簽屬會員,TAF已獲ILAC授權使用ILAC-MRA MARK;本中心亦獲TAF授權使用此一標記於檢測報告上,代表本中心的檢測能力已達到國際水準,並與全球 103經濟體、100認證機構之認可實驗室具有技術同等性。

服務項目列表:

Service Type
Service Code
Service Item
Technology Platform
Sample Management
C2-17
DNA Extraction from 5 mL Whole Blood  
----
C2-18
DNA Extraction from 10 mL Whole Blood
C2-19
DNA Storage
C2-26
DNA Extraction from Cultured Cell
SNP Genotyping
C2-7
ENU Mouse Gene Mapping Panel
Sequenom MassARRAY
C2-10
iPLEX SNP Genotyping
C2-12
Mouse Speed Congenics Panel (294 markers & 92 markers)
Whole-Genome SNP Genotyping
C2-15
Axiom Genome-Wide ASI Array Plate
Affymetrix GeneTitan
C2-16
Axiom Genome-Wide CHB Array Plate
C2-42
Axiom Genome-Wide TWB Array Plate
C2-58
Axiom Genome-Wide TWB 2.0 Array Plate
STRP Genotyping
C2-4
PCR Product STRP Genotyping
ABI 3730 DNA Analyzer
Next Generation Sequencing
C2-29
DNA sequencing sample preparation
illumina MiSeq
C2-36
mRNA sequencing sample preparation
C2-37
rRNA-Depleted RNA sequencing sample preparation
C2-43.1
MiSeq Sequencing Service (50 cycles)
C2-43.2
MiSeq Sequencing Service (150 cycles)
C2-43.3
MiSeq Sequencing Service (300 cycles)
C2-43.4
MiSeq Sequencing Service (300 cycles, Micro)
C2-43.5
MiSeq Sequencing Service (300 cycles, Nano)
C2-43.6
MiSeq Sequencing Service (500 cycles)
C2-43.7
MiSeq Sequencing Service (500 cycles, Nano)
C2-43.8
MiSeq Sequencing Service (600 cycles)
C2-48
SureSelect Exome Enrichment (Human/Mouse)
C2-51
DNA library sample preparation by Nextera XT
C2-52.1
MiSeq DNA Library QC (qPCR only)
C2-52.2
MiSeq DNA Library QC (Qubit Fluorometer + Agilent Bioanalyzer HS)
C2-52.3
MiSeq DNA Library QC (Qubit Fluorometer + Agilent Bioanalyzer HS + qPCR)
C2-55.1
RNA QC-Agilent RNA 6000 Nano
C2-55.2
DNA QC-Agilent DNA High Sensitivity
BioIT Services
C2-20
Samportal使用與諮詢
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C2-21
iQuestion使用與諮詢
C2-22
生物資訊分析、軟體開發與諮詢
C2-23
Samportal系統使用費率
C2-24
iQuestion系統使用費率
C2-38
NGS全基因體分析
C2-39
NGS Exome分析
C2-40
NGS RNA分析
C2-49.1
NGS運算分析服務
C2-49.2
NGS資料儲存服務
C2-53
生醫資訊系統使用與諮詢
C2-54
生醫資訊系統使用費率
Statistical Analysis
C2-56
Axiom Array全基因體關聯性分析
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C2-57
資料處理與統計分析
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Customized Service
C2-44
Customized Service
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