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| SNP Genotyping by Sequenom > 申請服務流程 |
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- NCGM-SNP組SNP鑑定
服務係採用美商SEQUENOM MassARRAY® System ,此平台可供用戶選擇較彈性的樣本數及任意數目的SNPs
申請鑑定實驗。此平台的特點在於可於單一well中進行多個SNPs
的鑑定實驗,但哪些SNP可於同一well 內進行鑑定實驗以及單一well
內最多可進行多少個SNPs,這些都取決於該批SNPs的primer設計結果,而primer設計的結果將決定該批實驗的所需費用(分成幾組反應進行以
及總primer費用)。因此當primer 設計完畢時,即可進行實驗費用精算,之後便可申請所需點數,申請鑑定實驗及訂購
SNP primer時,LIMS系統將會確認該計畫是否有足夠點數之後,方可進行申請動作,故各用戶於SNP鑑定實驗進行前所需準備的前置工
作有3項:
(1).建立LIMS帳號及申購點數。
(2). SNP primer設計。
(3).準備樣本
- 避免延誤實驗進行,實驗申請前請先檢查:
(1).點數是否足夠。
(2).primer是否已到貨及存量是否足夠。
(3).樣本存量,且樣本是否通過QC實驗。
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各計畫需有足夠點數方可透過LIMS申請實驗及訂購primer,但在補足所需點數之前可先申請送樣及primer
測試設計,而primer測試設計為非必需之流程。
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- SNP組每週一、三各處理一次排程,但會視服務申請量調整排程處理。
- 樣本送達後不會自動進入QC實驗排程,須由用戶提出申請方會進行。
- NCGM統一在星期四中午12:00截止primer設計訂購,於隔週星期一發出訂單。
- SNP Genotyping 所需時間,需依據用戶所提出的實驗申請量及當時NCGM已接受的服務量來決定。
- 避免延誤實驗進行,實驗申請前請先檢查:
| (1). 點數是否足夠。 |
| (2). primer是否已到貨及存量是否足夠(請留意各SNP primer的可作盤數)。 |
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(3). 樣本存量,且樣本是否通過QC實驗,等三項條件是否已達鑑定實驗需求,因Primer訂購通常最少需14個工作天,而新增點數也依貴
單位的請款 流程以及至國科會購買點數的方式,約需5 ~
14個工作天不等,且為減少等待時間,在Primer 到貨之前,可先進行新樣本之QC鑑定實驗。 |
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