1. |
Primer設計: |
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a. |
Forward primer:須有螢光標記(可請您的Primer合成廠商直接代為處理),本中心所使用Dye set為DS-33,可使用的螢光有FAM(藍色)、VIC(綠色)、NED(黃色)、PET(紅色)。 |
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b. |
Reverse primer:建議加上Poly A tail 可增進判讀的準確性及可靠性。 |
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2. |
每個樣本盤需保留2個空格在H11和H12的位置,因此每個樣本盤只放置94個樣本。此2個位置由STRP組加入Positive Control時使用,請勿加入任何液體或試劑。 |
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3. |
STRP PCR Product樣本盤製備方式 : |
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a. |
建議可將PCR Product進行Pooling的動作,Pooling的原則如下: |
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相同片段大小的PCR Product,所標定的螢光不同,可以Pool在同一個Well。 |
* |
標定相同螢光的PCR Product,其片段大小不同,亦可以Pool在同一個Well。 |
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b. |
製作Loading sample:PCR Product用水稀釋10~20倍來配製成Loading samples,稀釋倍數會因樣本而異。 |
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c. |
準備Hi-Di Formamide與Size standard的混合溶液,建議比例如下表: |
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每個樣本盤可任選一種Size standard |
混合比例 |
Hi-Di Formamide:Size standard (LIZ 500) |
120:1 |
Hi-Di Formamide:Size standard (LIZ 600) |
90:1 |
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d. |
在
欲放置樣本的96孔盤中之94個Well(H11和H12除外),各加入10 ul已配置好的Hi-Di Formamide與Size
standard混合溶液。用來盛裝樣本的96孔盤為MicroAmp 96 Well Reaction Plate或Thermo-Fast 96
Detection Plate。 |
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e. |
準備樣本盤:取1 ul已稀釋好的Loading samples,加入已放置10 ul Hi-Di Formamide與Size standard混合溶液的well中,每個well總體積為11 ul。 |
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f. |
未添加樣本的well也要加入11 ul Hi-Di Formamide與Size standard的混合溶液(H11和H12除外)。 |
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4. |
樣本盤製備完成後確認每個Well中沒有RNA、Protein、Salt、EDTA和其他異物(如雜質、顆粒和毛屑)。 |
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5. |
樣本盤的盛裝由用戶自行安排,若有分不同梯次的送樣,建議用戶每盤皆放置Control,作為不同批次結果比較的依據。 |
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6. |
NCGM所提供的結果為Raw data,不包含結果分析。用戶需親自至本中心使用GeneMapper v3.0軟體進行分析,首次使用軟體的用戶,本中心會提供教學服務,請用戶需要教學時先預約時間。 |